Samenwerking
De Stichting Herdenkingsstenen Amersfoort werkt samen met Ewijk Grafstenen en andere Amersfoortse bedrijven, Kamp Amersfoort, Stichting Schuilplaatsverleners, scholen (onder andere Corderius College, Gereformeerde Scholengemeenschap Guido de Bres, MBO Amersfoort), Politie Amersfoort en andere gerelateerde instellingen. Voor de herdenkingen worden altijd leerlingen uit het voortgezet onderwijs uitgenodigd. Bedrijven die gevestigd zijn in voormalige woningen van slachtoffers zijn betrokken bij de herdenkingen van deze voormalige bewoners.
Onderzoek
Bronnen voor onderzoek zijn bijvoorbeeld brieven en dagboeken van de slachtoffers zelf die bewaard zijn gebleven. Soms vinden of ontvangen we getuigenverslagen. We maken ook veel gebruik van de archieven zoals Archief Eemland, Joods Monument en Oorlogsgravenstichting, Nationaal Archief, Niod, Arolsen Archives en CBG|Centrum voor familiegeschiedenis.